An allen Gemeinschaftsschulen gibt es das Profilfach Naturwissenschaft und Technik, zusätzlich bietet jede einzelne Schule ein oder mehrere Profilfächer aus den Bereichen Musik, Kunst, Sport oder Informatik an. An der Altenburg-Gemeinschaftsschule wird Musik angeboten.
Alle Schüler*innen wählen in Klasse 7 ein Profilfach aus.